Дослідницька бібліотека НаУКМА розташовується у Староакадемічному (Мазепиному) корпусі (на реконструкції з 2017 р.), одному із найстаріших будинків з усього комплексу будівель НаУКМА. Він закладений за підтримки Івана Мазепи на території Братського монастиря 1703 року як навчальний будинок Академії.
